5月21日，南航在广州宣布，将紧急调用专机将四川卧龙保护区一批大熊猫运送到北京，拯救国宝大熊猫于危难之中。

　　汶川县是卧龙大熊猫的故乡，大地震不但造成数十万骨肉同胞死伤、480多万人无家可归，也让国宝大熊猫遭受强烈冲击, 国家级卧龙自然保护区大熊猫保护中心的圈舍已毁坏殆尽，两只大熊猫失踪，其余大熊猫被安置在临时的圈舍内。部分大熊猫已出现明显食欲不振、焦躁不安等症状。虽然大地震已过，但余震不断，以往憨态可掬、大腹便便的国宝大熊猫的生存状况每况愈下。

　　为拯救国宝，拯救大熊猫，南航决定，实行专机拯救国宝行动，将在5月24日紧急调用波音747-400全货机，采用专机运输、专业医生、专人护送的办法，免费将一批大熊猫从四川成都运送至北京，安置在北京国家动物园进行康复饲养，激励国人战胜灾难，鼓舞国人走出痛苦。 

　　5月20日晚8时，来自南航的数十名飞行员、安全员、乘务员，自发组织在南航广州总部为汶川大地震的死难同胞默哀，为在地震中受到惊吓的国宝大熊猫祈福。默哀人员中包括即将执行5月24日南航救援大熊猫专机的机长，该机长在过去的一周执行了南航多班波音747货机共760多吨救援物资的运输任务。

　　据了解，从5月12日截止5月21日下午18：00，南航采取合并和取消部分商业飞行，集中宽体机、大型货机，整合广州基地、各分子公司所有运力资源，共派遣包括世界最大最先进的波音747-400全货机、波音777、空客A330宽体客、货机等共128架飞机，共执行256个救援航班，飞行681小时，从全国15个地区，飞往成都、绵阳、九寨、重庆，其中成都202班（含货机14班），绵阳28班，九寨16班，重庆10班。运送武警、特警官兵和医疗救助人员近7239人，从灾区运出滞留人员15913人，运送救灾物资(包括血浆、搜救犬、药品、帐篷、探索灯、发电机等)1524吨,行李5669件；南航派出的3架直升机6次空投3400公斤救灾物资。21日，南航直升机还成功运送京河电站6名伤员至医院进行救治。